La citogenética es el estudio de los cromosomas, su estructura y su herencia, aplicado a la práctica de la genética médica.
En la actualidad, los notables avances en la resolución y la precisión han hecho que el análisis de los cromosomas sea un procedimiento de importancia creciente en numerosas áreas de la medicina clínica.
Los trastornos citogenéticos están presentes en cerca del 1% de los nacidos vivos, en alrededor del 2% de las gestaciones de mujeres mayores de 35 años que acuden a diagnóstico prenatal y en alrededor de la mitad de todos los abortos espontáneos de primer trimestre.

CARIOTIPO PRENATAL

Este estudio está indicado en los siguientes casos:

  • Edad materna avanzada (≥35años).
  • Ansiedad materna.
  • Anomalía serológica materna por el test de triple screening.
  • Anomalía fetal por ultrasonido (“marcadores ecográficos”).
  • Embarazo anterior con anomalías cromosómicas.
  • Hijo previo con anomalías cromosómicas.
  • Hijo previo polimalformado.
  • Historia familiar de trastornos cromosómicos.
  • Historia familiar de un trastorno ligado al cromosoma X para el que no existe un método específico de diagnóstico prenatal.
  • Reordenamiento cromosómico en uno de los parentales: en balance (translocación, inversión,...) o desbalanceado (marcador cromosómico, mosaicismo, aneuploidía sexual).
  • Riesgo de defecto del tubo neural
  • Gestaciones obtenidas mediante técnicas de reproducción asistida.
  • Otras causas que el ginecólogo considere importantes considerando la ayuda del asesoramiento genético oportuno.

Muestras:
Este estudio puede realizarse en:

1.- Líquido Amniótico:(Amniocentesis): 15-19 semanas de gestación.  La cantidad de muestra debe ser de 16- 20 mL en tubos de polipropileno estériles. Remitir al laboratorio en un plazo máximo de 24h a temperatura ambiente. Resultados: 14-21 días.
Consiste en la obtención de líquido amniótico por punción transabdominal mediante control ecográfico. El líquido amniótico contiene   células de la descamación de las membranas que rodean al feto y del propio feto que pueden cultivarse para hacer pruebas diagnósticas.

bebe Que es la Amniocentesis y cuando es necesario realizarla

Ventajas:
- Calidad metafases: 450-550 bandas.
- Baja tasa de contaminación materna.
- Detección de mosaicos.

Limitaciones:
Riesgo pérdida fetal (0.5%-1% sobre el riesgo basal que tiene cualquier embarazo en esa etapa de la gestación).
No detecta deleciones por debajo de la resolución del cariotipo (no detecta Sd.microdeleción).

 

2.- Vellosidad Corial:(Biopsia de Corion): 10-14 semanas de gestación. La cantidad de muestra debe ser ≥5mg de tejido. La muestra puede ser tomada mediante extracción transcervical o transabdominal. Debe ser remitida al Laboratorio en un tubo estéril con medio de transporte (RPMI 1640 con antibióticos facilitado por el laboratorio) en un plazo máximo de 24h a temperatura ambiente. Resultados: 14-21 días.

Ventajas:
La biopsia de corion, al realizarse en el primer trimestre de gestación, se presenta como una alternativa de indudables ventajas frente a la amniocentesis cuya extracción se realiza en el segundo trimestre de gestación.
Posibilita información genética más precozmente que la amniocentesis.
Contribuye a la reducción de trastornos psicológicos de la madre, y en el caso de interrupción del embarazo, supone ventajas obstétricas.

Limitaciones:
- Cantidad y calidad de metafases obtenidas.
-  Contaminación materna.
-  Pérdida fetal, debido al riesgo de la técnica de extracción (1% sobre el riesgo base del 2 al 5% existente en el primer trimestre de gestación).
-  No detecta deleciones por debajo de la resolución del cariotipo (no detecta Sd.microdeleción).
-  Mosaicismos confinados a placenta.
En todos los casos donde se observa un mosaico o una aneuploidía cromosómica rara es aconsejable realizar un estudio de líquido amniótico para confirmar el cariotipo fetal.

 

3.- Sangre de Cordón Umbilical (Funiculocentesis/Cordocentesis):
20-21 semanas de gestación. La cantidad de muestra debe ser  2-5 ml. Debe ser remitida al laboratorio en un tubo de heparina de litio  en un plazo máximo de 24h a temperatura ambiente. (Mantenimiento hasta su envío: 4ºC). Resultados: 7 días.
La cordocentesis se utiliza para obtener una muestra de sangre fetal directamente del cordón umbilical con guía ecográfica.
Esta técnica se utiliza en situaciones en las que se ha detectado anomalías fetales por ecografía y ha fallado el  cultivo de células de líquido amniótico o ha dado resultados ambiguos.

Ventajas:
Es una segunda muestra para confirmar un diagnóstico, cuando es demasiado tarde para realizar otras pruebas de diagnóstico prenatal.

Limitaciones:
- Pérdida fetal 2-5%.
-  No detecta deleciones por debajo de la resolución del cariotipo (no detecta Sd.microdeleción).

 

FISH PRENATAL

La necesidad de tener un conocimiento temprano del estado de salud fetal ha llevado al desarrollo de  técnicas que realizan un marcaje con sondas de ADN fluorescente. Rutinariamente se estudian los cromosomas 13, 18, 21, X, Y que son aquellos que con mayor frecuencia provocan  trastornos de aneuploidías, originando los Síndromes de Patau, Edwards, Down, Turner o Polisomías X y Klinefelter, Doble Y o Double Male entre los más frecuentes.

Muestras:
Este estudio puede realizarse en:
Vellosidad Corial.
Líquido amniótico.
Sangre de cordón umbilical.
(mismas muestras que para el cariotipo).

Envío de muestras: En un plazo máximo de 24h a la extracción de la muestra.  Envío será a temperatura ambiente.
Tiempo de entrega de resultados:
Este procedimiento se realiza en células no cultivadas y su diagnóstico requiere de 24-48 horas. 

 Ventajas:

  • Rapidez de la prueba (24-48h).
  • No necesita células cultivadas.
  • Reduce el nivel de ansiedad de los padres.

Limitaciones:

  • No excluye aneuploidías de otros cromosomas no analizados en las sondas ni alteraciones estructurales cromosómicas.
  • En muestras de líquido amniótico con contaminación hemática el resultado  puede ser no informativo.

Siempre debe complementarse con el Cariotipo fetal.

Comentario: Existe la posibilidad de detectar síndromes de microdeleción que se escapan a la resolución del cariotipo convencional y se pueden estudiar mediante sondas específicas (FISH) Ej: S.DiGeorge, S.Williams…
Ante la sospecha de un síndrome de microdeleción específico contactar con el Laboratorio.

 

BIOLOGIA MOLECULAR PRENATAL

QF-PCR PRENATAL.

La necesidad de tener un conocimiento temprano del estado de salud fetal ha llevado al desarrollo de  técnicas que detectan microsatélites del ADN con marcaje fluorescente. Rutinariamente se estudian los cromosomas 13, 18, 21, X, Y que son aquellos que con mayor frecuencia provocan  trastornos de aneuploidías, originando los Síndromes de Patau, Edwards, Down, Turner o Polisomías X y Klinefelter, Doble Y o Double Male entre los más frecuentes.

Muestras:
Este estudio puede realizarse en ADN que se extrae de:

  • Vellosidad Corial
  • Líquido amniótico
  • Sangre de cordón umbilical
    (mismas muestras que para el cariotipo)
  • Necesita una muestra adicional de sangre periférica EDTA de la madre

Envío de muestras: En un plazo máximo de 24h a la extracción de la muestra.  Envío será a temperatura ambiente.
Tiempo de entrega de resultados:
Este procedimiento se realiza en ADN extraído de células sin cultivar y su diagnóstico requiere de 48 horas. 

Ventajas:

  • Rapidez de la prueba (48h).
  • ADN (No necesita células cultivadas).
  • Prueba objetiva (FISH depende subjetividad observador)
  • Reduce el nivel de ansiedad de los padres.
  • Distingue la contaminación con sangre materna.

Limitaciones:

  • No excluye aneuploidías de otros cromosomas no analizados en las sondas ni alteraciones estructurales cromosómicas.

Siempre debe complementarse con el Cariotipo fetal.

 

Array-CGH Específico- PRENATAL

El diagnóstico prenatal es una materia en constante cambio, con continuas aportaciones de nuevos conocimientos  y tecnologías. Los profesionales de la salud deben ser conscientes de estos cambios y de la importancia de tener acceso a información actualizada a través de los propios programas de diagnóstico prenatal o de las clínicas de genética.
La detección de alteraciones genéticas durante el embarazo es una de las funciones más importantes del diagnóstico prenatal.
Por ello, se ha diseñado una plataforma de array-CGH, que realiza un cariotipo molecular, analizando el genoma completo de cada paciente, con una resolución aproximadamente 10 veces superior a la del cariotipo.
El Array Específico-Prenatal  es una herramienta que puede emplearse para detectar, de forma simultánea, la presencia o ausencia (amplificaciones o deleciones) de alteraciones genéticas y cromosómicas responsables de más de 100 síndromes congénitos que cursan con la presencia de malformaciones y/o retraso mental en diferentes grados de afectación. Esta plataforma genómica incluye desde síndromes cromosómicos frecuentes y conocidos como el Síndrome de Down hasta otros menos frecuentes, pero de gran impacto clínico como el Síndrome de Di George (se adjunta anexo el listado completo).
El Array Específico-Prenatal  está constituido por  un array-CGH que incluye 15000 sondas de oligonucleótidos, repartidas por el genoma humano completo a razón de 1 sonda cada 300 kilobases, dando una resolución media de detección de alteraciones de 1-1.5 megabases en todo el genoma.


Además,  el Array Específico-Prenatal  está centrado en la detección de alteraciones genéticas conocidas en genética médica y relacionadas con la aparición de cuadros sindrómicos. En estas regiones críticas, la resolución se aumenta unas 50 veces respecto a la que se obtiene en el cariotipo convencional y su potencia se iguala a cualquier otra tecnología molecular (FISH, MLPA, QF-PCR).

Indicaciones:

  • Edad materna avanzada (≥35años).
  • Ansiedad materna.
  • Anomalía fetal por ultrasonido (“marcadores ecográficos”).
  • Embarazo anterior con anomalías cromosómicas.
  • Hijo previo con anomalías cromosómicas.
  • Hijo previo polimalformado.
  • Historia familiar de trastornos cromosómicos.
  • Historia familiar de un trastorno ligado al cromosoma X para el que no existe un método específico de diagnóstico prenatal.
  • Reordenamiento cromosómico en uno de los parentales: en balance (translocación, inversión,...) o desbalanceado (marcador cromosómico, mosaicismo, aneuploidía sexual).
  • Riesgo de defecto del tubo neural.
  • Gestaciones obtenidas mediante técnicas de reproducción asistida.
  • Otras causas que el ginecólogo considere importantes considerando la ayuda del asesoramiento genético oportuno.

 

Ventajas:
- Por su resolución y su diseño orientado al diagnóstico genético.
- Protocolo reproducible y no depende de la obtención de metafases.
- Resultados fiables rápidamente.
- Tecnología altamente objetiva.
- Puede sustituir a la FISH prenatal, e incluso amplia la información.
- Elimina el riesgo de detectar CNV sin significado claro.
- Complementario al cariotipo convencional.
- Resultados de utilidad clínica.
Limitaciones:
- Permite detectar alteraciones en mosaico de hasta un 30% en la muestra (aproximadamente).
-  No se podrán diagnosticar aquellas alteraciones que no supongan una pérdida o una ganancia de material genómico, tales como: las mutaciones puntuales, las translocaciones o las inversiones balanceadas. Además, aquellas duplicaciones o deleciones inferiores al rango de resolución de la plataforma empleada o las alteraciones presentes en mosaico (en menos del 30% de la población celular), que podrían ser los causantes de la patología del paciente, también serán indetectables.
- No detecta poliploidías completas.

Muestra:
- Vellosidad Corial.
- Líquido amniótico.
- Sangre de cordón umbilical.
(mismas muestras que para el cariotipo).

Resultado: 5-10 días laborables.
72horas para casos de máxima urgencia.


NOTA INFORMATIVA: Adicionalmente, el Array Específico-Prenatal, debido a su alta resolución, puede detectar alteraciones cromosomales de ganancia o pérdida genómica presentes en un mosaico mínimo de un 30% de la muestra total, aunque no estén presentes específicamente en esta lista.

 

 

ANEXO:

Síndromes de microdeleción identificados con Array Específico-Prenatal

DESORDEN GENÉTICO

BANDAS

OMIM

Síndrome microdeleción 1p36

1pterp36

607872

Síndrome de microdeleción 1q43q44

1q43q44               

612337

Síndrome de Feingold                                          

2p24

164280

Síndrome de hipotonía-cistinuria

2p16.3

606407

Holoprosencefalia 2

2p21

157170

Síndrome de microdeleción 2p16.1p15

2p16.1p15

612513

Síndrome de joubert 4/ nefronoftisis 1

2q13

609583

Malformación split-hand/foot 5

2q31.1

606708

Sinpolidactilia 1

2q31.1

186000

Síndrome de microdeleción 2q31

2q31                       

612345

Síndrome de microdeleción 2q32q33

2q32-33

612313

Holoprosencefalia 6

2q37.1-q37.3

605934

Síndrome de braquidactilia-retraso mental

2q37.3qter            

600430

Síndrome de Dandy-Walker                                                      

3q24

220200

Microftalmia sindrómica 3                                                                

3q26

206900

Malformación split-hand/foot 4                                               

3q28

605289

Síndrome de microdeleción 3q29                           

3q29qter

609425

Síndrome de Wolf-Hirschhorn                                                 

4p16.3

194190

Síndrome de Axenfeld Rieger                                                          

4q25

180500

Síndrome de Cri-du-chat                                     

5pterp15.33

123450

Síndrome de Cri-du-chat región distal            

5p15.2

123450

Síndrome de Cornelia de Lange                                               

5p13.2

122470

Síndrome de Sotos                             

5q35.2

117550

Síndrome de microdeleción 6pterp24                         

6pter6p24                     

612582

Displasia cleidocraneal   

6p21.1               

119600

Síndrome de Prader-Willi-Like                                                         

6q16.3              

176270

Síndrome de Saethre-Chotzen                            

7p21                   

101400

Síndrome de cefalopolisindactilia de Creig   

7p13                   

175700

Síndrome de Williams Beuren                                                                      

7q11.23   

194050

Síndrome de duplicación de Williams Beuren                                          

7q11.23   

609757

Malformación Split-Hand/foot 1              

7q21.3                  

183600

Holoprosencefalia 3                                                 

7q36.3                     

142945

Síndrome de Charge                                                          

8q12.1                

214800

Síndrome de Larger Giedon                                                                                        

8q23q24

150230

Síndrome triconofaríngeo 1

8q23q24

190350

Deleción en 9q24.3 asociada a disgénesis gonadal 46,XY, total o parcial

9q24.3

154230

Síndrome de microdeleción 9p                                                            

9p                     

158170

Holoprosencefalia 7                        

9q22.3       

610828

Síndrome de Naill-Patella                                                          

9q34.1                      

161200

Síndrome de microdeleción 9q34.3                                                                        

9q34.3                   

610253

Hipoparatiroidismo, sordera sensorineural y enfermedad renal

10p15                   

146255

Síndrome de Digeorge 2                                                                    

10p14                      

601362

Síndrome de Digeorge 2, región Nebulette

10p13                   

601362

Síndrome microdeleción 10q23                                             

10q23             

612242

Malformación Split-Hand/ Foot 3                                            

10q24.32

600095

Síndrome Beckwith-Wiedemann                                                     

11pter                     

130650

Síndrome de microdeleción 11p15p14                                    

11p15p14                       

606528

 Síndrome WAGR (incluye región del tumor de Wilms)

11p13              

194072

Síndrome de Potocki-Shaffer                                              

11p11.2                      

601224

Síndrome de Jacobsen                                                                      

11q25qter                     

147791

Síndrome de Pallister-Killian

12pterpcen

601803

Síndrome de Patau (trisomía cromosoma 13)             

tri13                       

-

Holoprosencefalia 5                

13q32.3                         

609637

Microftalmia sindrómica 6          

14q22q23                          

607932

Síndrome de Prader-Willi/ Síndrome de Angelman                            

15q12               

176270

Hernia diafragmática congénita                                               

15q26qter                         

142340

Sínd.de microdeleción 1pter13.3 asociado a retraso mental/ alfa talasemia.

16pter-p13.3          

141750

Enfermedad poliquística renal infantil severa con esclerosis tuberosa

16p13.3

600273

Síndrome de Rubinstein-Taybi

16p13.3

180849

Síndrome de microdeleción 16p13.3/ Síndrome de Rubinstein-Taybi severo

16p13.3

610543

Síndrome de lisencefalia de Miller-Dieker

17p13.3

247200

Síndrome de duplicación 17p13.3

17p13.3

613215

Síndrome de Charcot-Marie Tooth, demielinizante, 1A

17p11.2

118220

Neuropatía hereditaria con sensibilidad a estímulos de presión

17p11.2

162500

Síndrome de Smith-Magenins

17p11.2

182290

Síndrome de Potocki-Lupski

17p11.2

610883

Síndrome de microdeleción NF1

17q11.2

162200

Síndrome de microdeleción 17q21.31

17q21.31

610443

Displasia campomélica

17q24.3

114290

Síndrome de Edwards

 tri18

-

Holoprosencefalia 4 

18p11.31

142946

Síndrome de Pitt-Hopkins

18q21.2

610954

Síndrome de microdeleción 18q

18qter

601808

Atresia aural congénita

18qter

607842

Síndrome de microdeleción 19q13.1

19q13.1

613026

Síndrome de Alagille 1

20p12.2

118450

Síndrome de Down

21q22

190685

Holoprosencefalia 1

21q22.3

236100

Síndrome Cat-Eye

22q11.1

115470

Síndrome de Digeorge/ Síndrome velocardiofacial

22pterq11.2

188400

Síndrome de microdeleción 22q11.2 distal

22q11.2

611867

Síndrome de microdeleción 22q13.3

22q13.3qter

606232

Síndrome de Turner

Del X

-

Síndrome de triple X

Tri X

-

Síndrome de Klinefelter (XXY)

XXY

-

Síndrome de deleción de genes contiguous de ictiosis complicada ligada al X

Xp22.31

308100

Distrofia muscular de Duchenne

Xp21.2

310200

Síndrome de microdeleción Xp11.3

Xp11.3

300578

Síndrome de duplicación Xp11.23p11.22

Xp11.23p11-22

300801

Retraso mental ligado al cromosoma X sindrómico, tipo Turner

Xp11.2

300706

Retraso mental ligado al cromosoma X con panhipopituitarismo

Xq26.3

300123

Síndrome de microdeleción de genes contiguous ABCD1/DXS1375E

Xq28

300475

Síndrome de duplicación MECP2

Xq28

300260

Alteraciones en el gen SRY

Yq11.3

-

Síndrome XYY

XYY

-

 

OTRAS PRUEBAS

DIAGNÓSTICO GENÉTICO PREIMPLANTACIONAL (DGP)

Permite ofrecer una opción reproductiva a las parejas con alto riesgo de trasmitir patologías genéticas a su descendencia, seleccionando los embriones sanos. Está indicado en casos de:

  • Portadores de alteraciones cromosómicas estructurales,
  • Abortos de repetición,
  • Fracasos previos en técnicas de reproducción asistida,
  • Pacientes con FISH de espermatozoides alterada,
  • Enfermedades hereditarias autosómicas o ligadas a los cromosomas sexuales.

El DGP se realiza en blastómeras fijadas en porta previamente biopsiadas del embrión en estadio de seis-ocho células. Se utiliza la técnica de FISH o de PCR específica, habiéndose establecido el proceso a seguir en un estudio previo de informatividad.

Envío de muestras: Inmediato (Blastómera fijada en porta).
Tiempo de entrega de resultados: 24-48 horas

 

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